论文

一株犬源致泻性大肠埃希菌噬菌体全基因测序及生物信息学分析

作者:姬明鑫1,2曹娜娜1郁杰雯1赵一1吴思雨1王利丽3张蕾1,2

刊物名称:特产研究

发表年月:2026.06

摘要内容:本研究旨在分离鉴定犬源致泻性大肠埃希菌噬菌体并对其生物信息学特征进行分析。收集发生腹泻的犬场污水,分离到一株大肠埃希菌噬菌体,通过透射电镜观察形态、测定宿主谱范围、对全基因测序、遗传进化分析并进行小鼠安全性试验。结果显示,分离到噬菌体属尾病毒纲噬菌体,命名为vB_EcoM_CC-01;该噬菌体可裂解多株犬源致泻性大肠埃希菌。全基因测序结果表明,vB_EcoM_CC-01噬菌体基因组为双链环状DNA,长度为166 451 bp,GC含量为35.52%,共具有271个开放阅读框。KEGG功能注释表明,vB_EcoM_CC-01噬菌体参与9条KEGG通路,在遗传信息处理基因最多。GO数据库注释表明,其基因功能主要是生物过程、细胞组分、分子功能三类;遗传进化分析提示vB_EcoM_CC-01噬菌体在主要衣壳蛋白和大亚基末端酶发育进化树中均形成独立分支。安全性试验结果表明,vB_EcoM_CC-01噬菌体对小鼠生长无影响。成功分离出安全、可裂解犬源致泻性大肠埃希菌尾病毒噬菌体,获得其全基因组序列并注释KEGG通路和GO数据库功能,研究结果为防治犬源致泻性大肠埃希菌方案提供理论基础。

原文链接:

https://kns.cnki.net/kcms2/article/abstract?v=1EB3pfwoRP5XVvjUSVN_NZfesZOOiyNLzpZU9b2ILKWaNwLXtiRcNPTkZCgAN9c4CPfirx11J63rEwQfJ2KJswu7MCsNm-UhrriwJ-NJevomcmTs2On3nNZosi66WA3ia_uirFEdgyP6qlBzWT9Ggpi-3506idAtypEZ1aN5VJp3EhQ80TOkRg==&uniplatform=NZKPT&language=CHS